Specimens collected by “Magali Schweizer” (34)

Specimen 3604

Species Rotaliida > Incertae sedis > Hyalinea > Hyalinea baltica
Isolate number 3604
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on May 2002
Location Oslofjord, Norway

Barcode sequence

SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatatcataatttatagtttatttacttcggtacttattctaatattatgtgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggtccataaatttatgtatgttgcgacgcattgacccctcatttaattatgagcgctgcgtctttgtcgtttagctcatgcgattggatcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacacttttatatgctgcgtacagttaatcctgtatgtattgtactgtaattgtgcaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatattcatacatcgcatgcgcgagtccatttattctgtgctttcgggcactgttttaaatgtgtatctctgcgcgcgataaagcctacttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttaatttatagcacacatatatacggcagctttacccagccagccttgttgctggatcttgtgtgtattgctgctttttccgtatgtgcaattgtcaattcatggtgggggcagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttcagggactggagttattttcaaccctatggaaactgaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatccagtaggtgaacct

See sequence on NCBI

Other sequence

SSU total

>Hyalinea balthica | genomic DNA | 3604 | taxon:203415 | small subunit ribosomal RNA ttaagccatgcaagtggttatatcaacccgacagtttaaataagtgttaaattgctacacattataaacgcaacattattcatctacatacagtgaatactttttacacagtatcacttacgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgacttggctattaaatattatgctatagcataaactgaactcacgcagtataatcgtatgctacaactacacacaaaaaaatgacatacgcgttctgtggaaggttagtgacctgcatagtaaatattaaaattaaaattgtttacaagctacgtacagtatctacgcagttgataccacacaacaactcactgcattttacgatctgtgcaagctgttttacaatgatttctctgtatcgcgttatacttacaagaacatgcgttacaccgtgacaaatttctttatggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgagtatttttaaaacacactgtaattgtgtaacataattatctctctacaggcgagtgcataacagcgcttaacggcagaatgaattattattcagcactttctacaacaacatactactcagcactcaatggtaagctttggttttttacgttcgcgtaattaccagtttaaagtttaactgcaacatgagagacattgagcacgcacgtggtggggtaatttattcgtttcgccacatctacgctgagcagactttgcgaagtttactttgcgaagcatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcaccgtacaatgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaatgctagtaccctacaaattacatagtattaatacaacaatttacaataaaacaagtttataaaacacgcacattataacacattatttcattctgtcctacagaatatcatacatatccttgttcgttgtaactcacgtaatttattttactgaggcagtgacaagctgtaacggttgagtataaaaatgacgagtgtctggcattgccgctctttcgggagcttggcaagttgccgacgctttgtgtgctcaattggaatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactacaatacatagaataataataaattctataagctagtttcgtacaaaaagtagcaatatatttgcagtacttactgttacagacactacatcacacacgaaacaacactgtgtctttcgtagctgcaagcctgtaaatagctatttttttacgtttcgacgcaccgtactaaattaatattattttattcatatagcttacggcaaccttgtaaataattacacacaaccaaatccattatttacgcggcagaattatactcgaattttttattctcctttcaacactgtgaacaaatcagagtgtatcaaacatgtcgtttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgggatgttgccttaattcaaacgcgttagaaatatttagctgtacgacagacatcacacacaaaccttacaatcactctgcgtactgttaatattatctaacacagtgccagtgacacatgaataatattttatatttctaacggttaaaaatgtcgatggggatagttggagtcaacagtactgctgggcgagaggtgaaattcattgaccctagcaagactaccaaaagcgaaagcagttggctaggctatactctttgtgattaactattcgtttgcagactctatgcgaagctttttaaacgctgctatacacacaaacattttcagcacgtactatagctattaacatacgagtcaaactcgcgaatacttatataacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattaattacatcaaacgatgggctctcaattgcattttacattaaattgcaaatttcctcagcctacaaaattactctggcttgagctcgtatttcgatacgctcgcctaatcaattttcgtacggtctctgatggacgtttcgtttaaaaatattttttgcgtgtaagcattgtattttatctttgaaacataagattatactgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaattctggtgagatgtaagcatcatgtcattgctacccgcagtgtatatcttcgggtatttcatctgtcgtgcgtagctgacactttttcgatgtgaagcacgctttaggcacgcgcttactgcagaaatgtctgagacattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatatcataatttatagtttatttacttcggtacttattctaatattatgtgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggtccataaatttatgtatgttgcgacgcattgacccctcatttaattatgagcgctgcgtctttgtcgtttagctcatgcgattggatcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacacttttatatgctgcgtacagttaatcctgtatgtattgtactgtaattgtgcaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatattcatacatcgcatgcgcgagtccatttattctgtgctttcgggcactgttttaaatgtgtatctctgcgcgcgataaagcctacttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttaatttatagcacacatatatacggcagctttacccagccagccttgttgctggatcttgtgtgtattgctgctttttccgtatgtgcaattgtcaattcatggtgggggcagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttcagggactggagttattttcaaccctatggaaactgaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatccagtaggtgaacct

See sequence on NCBI

Specimen 3966

Species Rotaliida > Incertae sedis > Nonionella > Nonionella labradorica
Isolate number 3966
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on May 2003
Location Skagerrak

Barcode sequence

SSU partial

>Nonionella labradorica | genomic DNA | 3966 | taxon:313611 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagctgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaaatactactaactatactcgtatatgtctgttgtatttatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacatttacgtgtgttgcggcactttgacccctcttattcacgtaagagcgcgtgtcttagtttttgcttagctcgcacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgccttttgataccaacggcgcattttgttcacattcactttcgcttgcgtttgtgtattgtgtataattgtgctgcaaaaaggctttctaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttgatacaccgcatgcgcgggccgcatttattttcagttccattcatttggttctgtttttaagtgtgtttttgctctgcgcgcggtaaagcctacttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttatttttatagcacacatatatatggcatttatgcccgggttgtactttgttgcagcttctgtgcgtatagatgttgaatacacactttttgtgttattcattaccatatgtgcaattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcacatatttgctttattgcattttttgcacgcctatggaaacttaaacgaacagtgtggtgtaaaggaaagagaagt

See sequence on NCBI

Other sequence

SSU partial

>Nonionella labradorica | genomic DNA | 3966 | taxon:313611 | 3966.27 | small subunit ribosomal RNA | s6-s14 region ccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactgccatgaagaatgaatcttaacacctttctactctttgtgtcaacagttttacgtatatgttttgggcttatagttcatttcatatacgttcgacgctgttataagaattttgcttacgcatatacgatttttacacggcacgttagcatacacgcgtatatacaaccttacacatacacacccacatttcgttgtatataccgtgtgtgacacacgcagcacttaatttcagaaatgtcttttcgtttgcatttgtgtgtgagacacactttggagcatttattctcatttcaacactgtgaacaaatcagagtgtatcaaacatgtcgtttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgggatgttgcgcactttcagccttttagaaagaagcctctcagcttttttctctctctcactatcacacatacacacacacacacacacacatcgtgaggaggcaaatactataagcgtatctttttttctaaaacggttaaaaatgtcgatggggatagttggagtcaacagtactgctgggcgagaggtgaaattcattgaccctagcaagactaccaaaagcgaaagcagttggctaggctatactctttgtgattgtattacgctattagtatctctcacatacacacacacacacacacacatgtggtaacactaattatgcgtatatacattacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattttttacatcaaacgatgggctctcaattgcaatttctatatagaattgtaaatttcctcaacctgcaaaataacttggcttgagctcgtatcattcttgatacgctcgcctcacttttttcgtacggtctcgacggacgtttcattttatcattttctttgcgtgtaagcattatgtatttattccttgaaacataggaattacattgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaaatttctggtgagatgtaagcactgtgtttctctgcccgcagcgtatgactatcggtcatttcgttctgtcgtttggtagtttaacaatcttggtgtgaagcacgctttaggcacgcgcttactgcagaaatgtctgagacattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaaatactactactatactcgtatatgtgctgtatttatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacatttacgtgtgttgcggcactttgacccctcttattcacgtaagagcgcgtgtcttagtttttgcttagctcgcacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccg

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Specimen C120

Cibicidoides lobatulus_C120
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number C120
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on May 2003
Depth 32m
Location Skagerrak
Latitude, Longitude 58.208, 11.241

Barcode sequence

SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaaacgcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgccttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaatttttacgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggtaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacct

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Other sequence

SSU total

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | C120 | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA ctcaaagattaagccgcaagtggttatattaacccgacagtttaaataagtgttaaatgctaccattaaacttatcgatatatcacgatagaccgattttgtttacgacggcagtaacaatttcagcgtgttatcacccatcacagtgaatcactgaaatttaccctacattcagtatcacttacgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgacttggcgcaataaaaattttcattgaaacaccctctcttcattgcgggggcagatcggtgatcatttttgttttgttgcattcacgcatacaaaatttttttgatttctctgtatcgcttattctttaaggacattgcgttacaccgtgacaattttttctttatggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgagtatattttatttttactacacatacgcacatacattcagattaatttttgtatcgctgtgtatcaactactactcagcactcaatggtaaactttggctgcgcttgcgcggtcagtttaaagtttaactgcaacatgagagacattgagcacgcacgtgttgcgtcttcggacgcttcacgtcacgctgagcagactttgcgaagtttactttgcgaagcatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcaccgtacaatgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaatgctagtaccctacaattcaaattgtatttacatgcgttacacaatttacaacattattacaagtttttaatgacagtacattataacactttcattttttctgttatcattacacatatatccttgttcgttgtactttcagcatatatagtattaatttattattttactgaggcagtgacaagctgtaacggttgagtataaaaatgacgagtgtctggcattgccgctctttcgggagcttggcaagttgccgacgctttgtgtgctcaattggaatgcggtgagtttaagcaactcagaacctttggacggtgttagtaaaatttcactgtttatgtatctgaatttcaagtggagggcaagtctggtgcnnnnnnccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactgcaaatacgaatgaacttctcattctgtttgaagttttacgcattaatatatatttctatctcgcatagatttattttttttttgcgttcgacgctgttaaaatttatacaatttcaccgttgtattaaattttagtttttacacggcacaaatttttactgtcgcacacgcattatatatatacatcatttctacgcacacacacacacacgatttatatattttgcaaacgcgcgggaaatctttgtattttttcgaacactcgcttagttatttattcgccttttcaacactgtgaacaaatcaragtgtattaaacatgtcgtttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgggatgttgcactttctgacgttaaagatttttactgcactttttacaagcgctgtacttgattttttccacacacgtttatctgtcatgctgcggcccgtttagggaagtatactagcatgcagggagagacgcacatgttacatgccacgtaaatattattatctcatactacccacacacggtaaattatttttaacggttaaaaaatgtcgatggggatagttggagtcaacagtattgctgggcgagcggtgaaatgcattgaccctagcaagactaccaaaagcgaaagcagttggctaggctatactctttgtgattatatatcttacgggacgctgctgtgctgcctgcgtgacacattttttttttctcagcattgctttatacggcattacacactgtacactgcgtatactgccatctttgcgaatttttttgtctcacacacagacacacacacacacagcgctgcgttatgcatatatatatacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattaattacatcaaacgatggactctcaattgcattttttattaaattgcaaatttcctcagcctacaaaatgacttggcttgagctcgtattttttatacgctcgcctaacttttttcgtacggtctcgatggacgtttcatttatatttttttgcgtgtaagcatttgttattctttgaaacataagaatgcattgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaattctggtgagatgtaagcactgtgtcatactacccgcagcatataccttcgggtattttgtctgtcgtgtgtagttgacaatcttggtgtgaagcacgctttaggcacgcgcttactgcagaaatgtctgagacactctcctctgggggaagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaaacgcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgccttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaatttttacgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggtaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacct

See sequence on NCBI

Specimen C170

Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number C170
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on September 2003
Depth <10m
Location Mediterranean Sea, Marseille, France
Latitude, Longitude 43.18, 5.22

Barcode sequence

SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggcaatcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgcgtcttagtttccgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcctgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaattttcgaattgcgcgcatttgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggctaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactggggacgcagaaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtgtaacaaggca

See sequence on NCBI

Other sequence

SSU total

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | C170 | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA ctcaaagattaagccatgcaagtggttatattaacccgacagtttaaataggtgttaaatgctaccattaaacttatcgtatatcacgcatagaccgattttgtttacggcagtaacaatttcagcgtgttatcacccatcacagtgaatcactgaaatttaccctacattcagtatcacttacgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgacttggcgcaataaaaattttcattgagacaccctctctctctctctctcttttgcgggactgactgggcagatcggtgatcatttttgttttgttgcattcacgcatacaaaatttttttgatttctctgtatcgcttattctttaaggatcattgcgttacaccgtgacaatttttttctttatggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgagtatatatttttttatttacccacatacgcacacacactcaaattaatttttgtatcgctgtgtatcaactactactcagcactcaatggtaaactttggctgcgcttgcgcggtcagtttaaagtttaactgcaacatgagagacattgagcacgcacgtgttgtgtcttcggacgcttcacatcacgctgagcagactttgcgaagtttactttgcgaagcatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcaccgtacaatgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaatgcgagtaccctacaattcaaattgtatttacatgcgttatcaacaatttacaacattacatacaagtttttaatgacagcacattataacactttcattttattctgttatcattatacacatatatccttgttcacgttgtactttcagcatattataatattaatttattattatttactgaggcagtgacaagctgtaacggttgagtataaaaatgacgagtgtctggcattgccgctctttcgggagcttggcaagttgccgacgctttgtgtgctcaattggaatgcggtgagtttaagcaactcagaacctttggacggtgttagtaaaatttcactgttnnatgtatctgaatttcaagttgagggcaagtctggtgcnnnnnnccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactgcaaatacgaatgaatttctcattctgtttgaagttttacgcattaattatatacgtatatatttctgcgcgtctcgcacgcatagatttattattattattttttctgcgttcgacgctgttaaaatttatacaatttcaccgttgtattaaattttagtttttacacggcgcaaatttttactgcacacgcattatatattatttttctacgcacacaccctttatgtattttgccaacgcgggaaatatttgtgattcgaacactcgcttagaatttattcgccttttcaacactgtgaacaaatcagagtgtatcaaacatgtcgtttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgggatgttgcactttctgacgttaaaaatttttacgtgcctctgttttacaagcgctgtacattattttttacacacacgtttatctgtcatgctgcggcccgtttagggaagttatactagcatgcagggagagacgcacatgttacatgccacgtaaatattattatctcaatactcttttacggtaaattatttttaacggttaaaaatgtcgatggggatagttggagtcaacagtactgctgggcgagcggtgaaatgcattgaccctagcaagactaccaaaagcgaaagcagttggctaggctatactctttgtgattatatatattttacgcacgctacgctgcagtgataattttttcgccattgctttatacggtattacacacactgtacactgcgtatactgccattttgaaatttttactcacacacacacagcacacgcgctgcgttatcatatacatatatacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattaattacatcaaacgatggactctcaattgcattttttattaaattgcaaatttcctcagcctacaaaatgacttggcttgagctcgtattttttatacgctcgcctaacttttttcgtacggtctcgatggacgtttcatttatattttttgcgtgtaagcatttgttattctttgaaacataagaatgcattgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaattctggtgagatgtaagcactgtgtcatactacccgcagcatataccctcgggtattttgtctgtcgtgtgtagttgacaatcttggtgtgaagcacgctttaggcacgcgcttactgcagaaatgtctgagacactctcctctgggggaagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggcaatcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgcgtcttagtttccgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcctgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaattttcgaattgcgcgcatttgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggctaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactggggacgcagaaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtgtaacaaggca

See sequence on NCBI

Specimen C171

Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicides > Cibicides refulgens
Isolate number C171
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on November 2001
Depth <10m
Location Mediterranean Sea, Marseille, France
Latitude, Longitude 43.18, 5.22

Barcode sequences

SSU partial

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C171.2 | D. Longet C171 (UniGE) | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatattacaccctctctcgtagatgtgtgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtttatgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttatgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacggaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcatataatttcgattacttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

SSU partial

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C171.4 | D. Longet C171 (UniGE) | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatattacactctctctcgtagatgtgtgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtttatgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacacggcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttatgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcatataatttcgattacttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

SSU partial

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C171.6 | D. Longet C171 (UniGE) | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA attgacaggcaatattaatattacactctctctcgtagatgtgtgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggaactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtttatgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttattaaaccaagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgaagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttatgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatataccgcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcatataatttcgattacttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacct

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Specimen C172

Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicides > Cibicides refulgens
Isolate number C172
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on September 2003
Depth <10m
Location Mediterranean Sea, Marseille, France
Latitude, Longitude 43.18, 5.22

Barcode sequences

SSU partial

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C172.1 | D. Longet C172 (UniGE) | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatattacactctcttcgtagatgtgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtgtttgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagcgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttttgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcatataatttcgattacttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

SSU partial

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C172.6 | D. Longet C172 (UniGE) | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatattacactctcttcgtagatgtgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtttatgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggccgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttttgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgcatcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcatataatttcgattacttgcacgcctatggaaacttaaac

See sequence on NCBI

Specimen C173

Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicides > Cibicides refulgens
Isolate number C173
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on September 2003
Depth <10m
Location Mediterranean Sea, Marseille, France
Latitude, Longitude 43.18, 5.22

Barcode sequences

SSU partial

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C173.1 | D. Longet C173 (UniGE) | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA annaggtaaatagntgtttcaanngnnncnntcncaattccacacaacatacnnnncggattcgattagctatgcgtatatttgctatacacacgctttagaatttattctcctttcaacactgtgaacaaatcagagtgtatcaaacatgtcgtttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgggatgttgcactttctgcgttaaaaatttattactgcttcgtgctgtaattatttttttacacacacacacacacacatacgcacatgttgtatgccacgtaaataatttttaacggttaaaaatgtcgatggggatagttggagtcaacagtactgctgggcgagaggtgaaattcattgaccctagcaagactaccaaaagcgaaagcagttggctaggctatactctttgtgattatatatattttatcacgcataaatatacacacacacacatacacactcacgtatatacatgcggtcagtatatatacatacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattaattacatcaaacgatgggctctcaattgcatttttcattaaattgcaaatttcctcaacctacaaaatgacttggcttgagctcgtattttttatacgctcgcctaacttttttcgtacggtctcgatggacgtttcatttaaatttttttgcgtgtaagcatttgttattctttgaaacataagaatgcattgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaattctggtgagatgtaagcactatgttatactatccgcagcatatgtcttcgggcattttgtctgtcgtgtttagttaacaatttcggtgtgaagcacgctttaggcacgcgcttactgcagaaatgtctgagacattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatattacactctcttcgtagatgtgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgcctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtgtttgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacatgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttttgttttaaatgtgtatctctgcacgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaggactgggaacgcatataatttcgattatttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaac

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SSU partial

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C173.1b | D. Longet C173 (UniGE) | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatattacactctcttcgtagatgtgtgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgcctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtgtttgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacatgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttttgttttaaatgtgtatctctgcacgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcatataatttcgattatttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaac

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SSU partial

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | 576 | J. Pawlowski 576 (UniGE) | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA accgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaaacgcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaatttttacgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctgca

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Specimen C184

Cibicidoides Wuellerstorfi_C184
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides wuellerstorfi
Isolate number C184
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on October 2003
Habitat soft sediment
Depth 2774m
Location Portugal, Setubal Canyon
Latitude, Longitude 38.1202, -9.1699

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides wuellerstorfi | genomic DNA | C184 | taxon:325266 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccatcaagacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatactttgcttcggcattgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgtatcgcacttcgacccctttctttaattagaaagcgcgtgtcttagtttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgtttattcattttttaatgttcattcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtacctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgtgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctgcagaaggatca

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Specimen C196

Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides pachyderma
Isolate number C196
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on October 2003
Habitat soft sediment
Location Portugal, Nazaré Canyon
Latitude, Longitude 39.385, -9.1699

Barcode sequence

SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgtgttcgcacgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcggcactttgacccctttcttcggaaagcgcgtgtcttagtttgctttgctcacacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgtttgtcatttttatggcattcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacttcggtgctttaaatgtgtatttctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttagcacacatatatacggcgtctatacccgggttaccttgttgtaacttttgtgtgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacaggccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcagaatttattctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaagacatcggtaggtgaacct

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Other sequence

SSU total

>Cibicides pachyderma | genomic DNA | C196 | taxon:349560 | small subunit ribosomal RNA ctcaaagattaagccatgcaagtggttatattaacccgacagtttaaataagtgttcaatgctacattaaacttatcacatatcacgcatagatgattttgtttacagtagtaacaatttcagcgtgaatcacccatcacagtgaatcactgaaatttacccaatatcagtatcacttacgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgacttggcgtaataaaaattttcattgaaacacccgctcgcgggcagctcggtgaatttttttattttgttgcatcacgcatacaaaattttttgatttctctgtatcgcttattcttaaggacatgcgttacaccgtgacaattttctttatggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgagtactttaccacacacacacacacacacacacacacactcaacaattcaaaatttttttgtattgctgtgcatcaactactactcagcactcagtggtaaactttggccgcctcgcgcagtcagtttaaagtttaactgcaacatgagagacattgagcacgcacgtgtcgtgtcttcggacacttcacatcacgctgagcagactttgcgaagtttactttgcgaagcatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgaccccatagaaggagcaccgtacaatgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaatgctagtaccctacaatcaaattgtatttacatgcgttaacaatttacaacattacaagttttaatgacagacattataacactttcattttttctgttatattacacacatatatatccttgttcgttgtattcagcatccataatattaatttattattttactgaggcagtgacaagctgtaacggttgagtataaaaatgacgagtgtctggcattgccgctctttcgggagcttggcaagttgccgacgctttgtgtgctcaattggaatgcggtgagtttaagcaactcagaacctttggacggtgttagtaaaatttcactgctcgtgtatctgaatttcaagtggagggcaagtctggtgcnnnnnnccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgagctgcaaatacgaatgaatttctcattctgtttgaagttttacgctttaatcactcgtgattttttgcgttcgacgcctgttaaaatttatacaattttttctgttgtattaaatttttcatttacacggcacaaatattttctgccgcatacattttattacatcacacacacacacacacacacgttgtaataataataaacgtatgcatttcaacgctgaaaacttttgtattcaaacactcgtttaaaatttattctccttttcaacactgtgaacaaatcagagtgtatcaaacatgtcnttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgagatgttgcactttctgcgtwaaaaatttttattgcctgtttacagcgctgtattcatttttagcattacacacacacacagcacgcacatgttacatgccacgtaaataatttttctatacatacgataaatttttttaacggttaaaaatgtcgataggggatagttggagtcaacagtactgctgggcgagaggtgaaattcattgaccctagcaagactaccaaaagcgaaagcagttggctaggctatactytttgtgattatatttttatgcgacgtagcttacgctgaaatttttttgcattacacacatacacacactgcatcaaattttttttttggcgcttcgctgcagcatatacatatatatacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagagggtcagataccctcgtcgtcccattaattacatcaaacgatgggctctcaattgcattttttattaaattgcaaatttcctcagcctacaaaataacttggcttgagctcgtatttttatacgctcgcctaacttttttcgtacggtctcgatggacgtttcatttatattttttgcgtgtaagcatttgttattctttgaaacataagaatgcattgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaattctggtgagatgtaagcactgtgtcacactacccgcagcatatgtcttcgggcattttgtctgtcgtgtgtagttgacaatcttggtgtgaagcacgctttaggcacgcgcttactgcagaaatgtctgagacattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgtgttcgcacgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcggcactttgacccctttcttcggaaagcgcgtgtcttagtttgctttgctcacacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgtttgtcatttttatggcattcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacttcggtgctttaaatgtgtatttctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttagcacacatatatacggcgtctatacccgggttaccttgttgtaacttttgtgtgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacaggccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcagaatttattctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaagacatcggtaggtgaacct

See sequence on NCBI

Specimen C2

Cibicidoides lobatulus_C2
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number C2
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on September 2001
Habitat sand bottom
Depth intertidal
Location Iceland, Sandgerdi
Latitude, Longitude 64.02, -22.42

Barcode sequences

SSU partial

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | C2.2 | T. Cedhagen C2 (UniGE) | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgrgaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaatcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattaaagagcgcgtgtcttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaattttcgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagttgtaacaaggca

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SSU partial

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | C2.9 | T. Cedhagen C2 (UniGE) | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagtatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaatcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttaattttcgctttgctcatacaattaagtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaattttcraattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactaaarggaccgctgttactttcttaaaccaaaagaaggttgcrgcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcaatgagcatctcatttttacacacccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgtwttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgcctcgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctgcagaaggatca

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Specimen C208

Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicides > Cibicides refulgens
Isolate number C208
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on September 2003
Depth <10m
Location Mediterranean Sea, Marseille, France
Latitude, Longitude 43.18, 5.22

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SSU partial

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C208.6 | F. Sinniger C208 (UniGE) | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatattacactctcttcgtagatgtgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtttatgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttatgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcatataatttcgattacttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtgtaaca

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Specimen C218

Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicides > Cibicides refulgens
Isolate number C218
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2004
Location Mediterranean Sea

Barcode sequence

SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatactacactctcttcagagatgtgtattttatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtttatgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttatgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcatataatttcgattacttgcacacctatgaaaactaaaccgaaaag

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Other sequence

SSU total

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C218 | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA tatattaacccgacagtttaaataagtgttaaatgctacattattaaacttacatcatatcacgcataccacgattttgtttaccgtagtaacaatttcagcgtgacgcacatatatcttcgcgatatagtgaatcactgaaatttacccattcagtatcacttacgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgacttggcgtaataatatacaatgaaattttcatttcgaaatatatactcgctcgcgggtgtatgtgacggccgaattttttatttttattatttttttttgttgccttcacacgcactacaaaaatttatatattgatttctctgtatcgcttattcttaaggacaakgcgttacaccgtgacaattttctttatggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgagtacattttacaccacacacacacacacacacacatacacnnantatatatttttgtatctacgctgtgtawcaacaatacatacatcmttactcmkcactcaatggtaakcttwggctgcgttcgcgtagccagttyaaagttwaactgcaacatgagagacattgacgcacgcacgtgttgtatcttcgggtacytcacatcacgctgagcagactakgckaagtttastttgcgaagcatrtcatacaagcatmtacagcaycaagtcacagggygtggswrtgtgtattttttgmacctycmamgcastcmcgcawassgaagagtagtttmtgatcccatagaaggagcrccgcacaatgagagaccgctcttagttttaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaatgctagtaccgtacaatactaattgtattttacaatgcgttaaaccaattcacataccaacaagtttatacataatattacacatataacacttctattttttctgttgatgttaatttacatcaattagaacatacatacatatccttgttcgttgtttatttatcagcatcataatattattattatattattttactgaggcagtgacaagctgtaacggttgagtataaaaatgacgagtgtctggcattgccgctctctcgggagcttggcaagttgccgacgctttgtgtgctcaattggaatgcggtgagtttaagcaactcagaacctttggacggtgttagtaatatttcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactgcacgtatgcgaatgaatttctcattctgtttggaagtttttttacgctttatttaattctgaattatttattgcgttcgacgctgttacaaaatttttattttttacacgggacaaatatacatatacgtatatatcacacacacacatacccattcgatatatataagctatgcgtatatttgcgtatatttgctatacacacgctttagaatttattctcctttcaacactgtgaacaaatcagagtgtatcaaacatgtcgtttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgggatgttgcactttctgcgttaaaaatttattactgcttcgtgctgtaattatttttcacacacacacacacacacacacacacatacgcacatgttgtatgccacgtaaataatttttaacggttaaaaatgtcgatggggatagttggagtcaacagtactgctgggcgagaggtgaaattcattgaccctagcaagactaccaaaagagagagcagttgggtagggtatactctttgtgattatatatattttatcacgcataaatatacacacacacacatacacactcacgtatatacatgcggtcagtatatatacatacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattaattacatcaaacgatgggctctcaattgcatttttcattaaattgcaaatttcctcaacctacaaaatgacttggcttgagctcgtattttttatacgctcgcctaacttttttcgtacggtctcgatggacgtttcatttaaatttttttgcgtgtaagcatttgttattctttgaaacataagaatgcattgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaattctggtgagatgtaagcactatgttatactatccgcagcatatgtcttcgggcattttgtctgtcgtgtttagttaacaatttcggtgtgaagcacgctttaggcacgcgcttactgcagaaatgtctgagacattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatactacactctcttcagagatgtgtattttatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtttatgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttatgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcatataatttcgattacttgcacacctatgaaaactaaaccgaaaag

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Specimen C24

Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number C24
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2002
Habitat soft sediment
Depth 54m
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.391, 10.373

Barcode sequence

SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactggagggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaatcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaattttcgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtggatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattactgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacct

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SSU total

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | C24 | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA gtttaaataagtgttaaatgctaccattaaacttatcgtatatcacgcatagaccgattttgtttacggcagtaacaatttcagcgtgttatcacccatcacagtgaatcactgaaatttaccctacattcagtatcacttacgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgacttggcgcaataaaaattttcattgaaacaccctctcttttttgcgggggcagatcggtgatcatttttgttttgttgcattcacgcatacaaaatttttttgatttctctgtatcgcttattctttaaggacattgcgttacaccgtgacaattttttctttatggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgagtatatttttactacacatacgcacacacattcaaattaatttttgtatcgctgtgtatcaactactactcagcactcatggtaaactttggccacgcttgcgcggtcagtttaaagtttaactgcaacatgagagacattgagcacgcacgtgttgtgtcttcggacgcttcacatcacgctgagcagactttgcgaagtttactttgcgaagcatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcaccgtacaatgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaatgctagtaccctacaattcaaattgtatttacatgcgttacacaatttacaacattatacaagtttttaatgacagtacattataacactttcattttttctgttatcattacacatatatccttgttcgttgtactttcagcatatatagtattaatttattattttactgaggcagtgacaagctgtaacggttgagtataaaaatgacgagtgtctggcattgccgctctttcgggagcttggcaagttgccgacgctttgtgtgctcaattggaatgcggtgagtttaagcaactcagaacctttggacggtgttagtaaaatttcactgtttatgtatctgaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactgcaaatacgaatgaatttctcattctgtttgaagttttacgcattaatatatatacatatttctatctcgcatagatttatttatttttttttgcgttcgacgctgttaaaatttatacaatttcaccgttgtattaaattttagtttttacacggcgcaaatttttactgcacacgcattatatagattttttctacgcacacacgctttatattttgccaacgcgggaaatctttgtatttttcgaacactcgcttaraatttattcgccttttcaacactgtgaacaaatcagagtgtatcaaacatgtcgtttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgggatgttgcactttctgacgttaaaaatttttactgcactttttacaagcgctgtactttttttttccacacacgtttatctgtcatgctgcggcccgtttagggaagttatactagcatgcagggagagacgcacatgttacatgccacgtaaatattattatctcatactatccacggtaaattatttttaacggttaaaaatgtcgatggggatagttggagtcaacagtactgctgggcgagcggtgaaatgcattgaccctagcaagactaccaaaagcgaaagcagttggctaggctatactctttgtgattattatatcttacgcacgctgcgtgacaatttttcctcactttgcttttatacggcattacacactgtacactgcgtatactgcgcattttggaatttttttcacacacagcgctgcgttatcatatatatatatacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattaattacatcaaacgatggactctcaattgcattttttattaaattgcaaatttcctcagcctacaaaatgacttggcttgagctcgtattttttatacgctcgcctaacttttttcgtacggtctcgatggacgtttcatttatattttttgcgtgtaagcatttgttattctttgaaacataagaatgcattgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaattctggtgagatgtaagcactgtgtcatactacccgcagcatataccttcgggtattttgtctgtcgtgtgtagttgacaatcttggtgtgaagcacgctttaggcacgcgcttactgcagaaatgtctgagacactctcctctgggggaagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactggagggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaatcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaattttcgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtggatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattactgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacct

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Specimen C29

Cibicidoides ungerianus_C29
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides ungerianus
Isolate number C29
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2002
Habitat soft sediment
Depth 195m
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.391, 10.37

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides ungerianus | genomic DNA | C29 | M. Schweizer C29 (UniGE) | taxon:349559 | small subunit ribosomal RNA aacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacttttttgcttcggcattgagtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcatcgcactttgacccctttcttaattgaaagcgcgtgtcttagtttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgtttgtataatttttattacgcattcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggcgttttaaatgtgtacctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggt

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Specimen C35

Cibicidoides lobatulus_C35
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number C35
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2002
Habitat Epizoic/Gastropod test
Depth 54m
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.391, 10.37

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | C35 | M. Schweizer C35 (UniGE) | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA tcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaaacgcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaatttttacgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctg

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Specimen C37

Cibicidoides lobatulus_C37
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number C37
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2002
Habitat Epizoic/Gastropod test
Depth 54m
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.391, 10.37

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | C37 | M. Schweizer C37 (UniGE) | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA cgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaatcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaattttcaaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaac

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Specimen C39

Cibicidoides lobatulus_C39
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number C39
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2002
Habitat Epizoic/Gastropod test
Depth 54m
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.391, 10.37

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | C39 | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaaacgcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaatttttacgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctgcagaaggatca

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Specimen C40

Cibicidoides lobatulus_C40
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number C40
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2002
Habitat Epizoic/Gastropod test
Depth 54m
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.391, 10.37

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | C40.3 | M. Schweizer C40 (UniGE) | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA ctgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaaacgcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttagttttcgccttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaatttttacgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaaagtgggtaaatcaattagaagtaatgattttcctttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggattacctgttgtagcttttgtgcgtatagatgtttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctgcagaaggatca

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Specimen C78

Cibicides refulgens_C78
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicides > Cibicides refulgens
Isolate number C78
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on November 2002
Depth <10m
Location Mediterranean Sea, Planier Canyon, France
Latitude, Longitude 43.02, 5.12

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides refulgens | genomic DNA | C78 | J.-P. Gillig C78 (UniGE) | taxon:212459 | small subunit ribosomal RNA aaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatattacactctcttcgtagatgtgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcggcactttgaccccttttctcgttaaaagcgcgcgtcttagtttgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttattaccaaacattgtttatgcgttctgcgcatatcgatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcattatccttcgggttatgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttttagcacacatatatacggcgtttatacccgggtaatgcttgtcgttacttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtcctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagttgagggactgggaacgcatataattcgattacttgcacacctatggaacttaacgaacagtgtgtct

See sequence on NCBI

Specimen C86

Cibicidoides pachyderma_C86
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides pachyderma
Isolate number C86
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on October 2003
Habitat soft sediment
Depth 338m
Location Portugal, Nazaré Canyon
Latitude, Longitude 39.3891, -9.1471

Barcode sequence

SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgtgttcgcacgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcggcactttgacccctttcttcggaaagcgcgtgtcttagtttgctttgctcacacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgtttgtcatttttatggcattcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacttcggtgctttaaatgtgtatttctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttagcacacatatatacggcgtctatacccgggttaccttgttgtaacttttgtgtgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcagaatttattctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacct

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Other sequence

SSU total

>Cibicides pachyderma | genomic DNA | C86 | taxon:349560 | small subunit ribosomal RNA catgcaagtggttatattaacccgacagtttaaataagtgttcaatgctacattaaacttatcacatatcacgcatagatgattttgtttacagtagtaacaatttcagcgtgaatcacccatcacagtgaatcactgaaatttacccaatatcagtatcacttacgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgacttggcgtaataaaaattttcattgaaacacccgctcgcgggcagctcggtgaatttttttattttgttgcatcacgcatacaaaattttttgatttctctgtatcgcttattcttaaggacatgcgttacaccgtgacaattttctttatggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgagtactttaccacacacacacacacacacacacacactcaacaattcaaaatttttttgtattgctgtgtatcaactactactcagcactcartggtaaactttggctgcctcgcgcagtcagtttaaagtttaactgcaacatgagagacattgagcacgcacgtgtcgtgtcttcggacacttcacatcacgctgagcagactttgcgaagtttactttgcgaagcatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcaccgtacaatgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaatgctaataccctacaatcaaattgtatttacatgcgttaacaatttacaacatacaagttttaatgacagacattataacactttcattttttctgttacattacacacatatatatccttgttcgttgtattcagcatccataatattaatttattattttactgaggcagtgacaagctgtaacggttgagtataaaaatgacgagtgtctggcattgccgctctttcgggagcttggcaagttgccgacgctttgtgtgctcaattggaatgcggtgagtttaagcaactcagaacctttggacggtgttagtaaaatttcactgttcgtgtatctgaatttcaagcggagggcaagtctggtgccagcagccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactgcaaatacgaatgaatttctcattctgtttgaagttttacgctttaatcactcgtgattttttgcgttcgacgcctgttaaaatttatacaattttttctgttgtattaaatttttcatttacacggcacgaatattttctgccgcatacattttattacaccacacacacacacacacacacgttgtaataataaacgtatgcatttcaacgctgaaaacttttgtattcraacactcgtttaraatttattctccttttcaacactgtgaacaaatcagtgtgtatcaaacatgtckttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgggatgttgcactttctgcgttaaaaatttttattgcctgtttacagcgctgtattcatttttagcattacacacacacacagcacgcacatgttacrtgccacgtaaataatttttctatacatacgataaatttttttaacggttaaaartgtcgatggrgatagttggagtcaacagtactgctgggcgagaggtgaaattcattgaccctagcaagactaccaaaagcgaaagcagttggctaggctatactctttgtgattatatttttatgcgacgtagcttacgctgaaatttttttgcattacacacacacacacactgcatcaaatttttttttggcgcttcgctgcagcatatacatatatatacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagagaatcagataccctcgtcgtcccattaattacatcaaacgatgggctctcaattgcatcttttattaaattgcaaatttcctcagcctacaaaataacttggcttgagctcgtatttttatacgctcgcctaacttttttcgtacggtctcgatggacgtttcatttatattttttgcgtgtaagcatttgttattctttgaaacataagaatgcattgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaattctggtgagatgtaagcactatgtcacactacccgcagcatatgtcttcgggcattttgtctgtcgtgtgtagttgacaatcttggtgtgaagcacgctttaggcacgcgcntactgcagaaatgtctgagacattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgtgttcgcacgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcggcactttgacccctttcttcggaaagcgcgtgtcttagtttgctttgctcacacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgtttgtcatttttatggcattcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacttcggtgctttaaatgtgtatttctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttagcacacatatatacggcgtctatacccgggttaccttgttgtaacttttgtgtgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcagaatttattctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacct

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Specimen C87

Cibicidoides pachyderma_C87
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides pachyderma
Isolate number C87
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on October 2003
Habitat soft sediment
Depth 338m
Location Portugal, Nazaré Canyon
Latitude, Longitude 39.3891, -9.1471

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides pachyderma x kullenbergi | genomic DNA | C87 | T. Kouwenhoven C87 (UniGE) | taxon:378218 | small subunit ribosomal RNA caagcttgatatgcaagcgaacctaatgmgkgatcgcacgtattatgttaaatatgctagtyctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcggcactttgacccctttcttcggaaagcgcgtgtcttagtttgctttgctcacacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgtttgtcatttttatggcattcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacttcggtgctttaaatgtgtatttctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttagcacacatatatacggcgtctatacccgggttaccttgttgtaacttttgtgtgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcagaatttattctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcggtaggtgaacctgcag

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Specimen F182

Cibicidoides lobatulus_F182
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number F182
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on October 2006
Habitat Epizoic/Tunicate
Depth 148m
Location Norway, Bergen
Latitude, Longitude 60.18, 5.12

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | F182 | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA | s14-sB cttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaaacgcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaatttttacgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttattctgcacacctatggaaacttaaacg

See sequence on NCBI

Specimen F277

Ammonia falsobeccarii F277
Species Rotaliida > Rotaliidae > Ammonia > Ammonia falsobeccarii
Isolate number F277
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on December 2006
Habitat soft sediment
Depth 60m
Location Rhone delta, off France
Latitude, Longitude 43.18, 4.45

Barcode sequence

SSU partial

>Ammonia falsobeccarii | genomic DNA | F277 | taxon:1004394 | small subunit ribosomal RNA ggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacagatatacgctgcgttatgtccttcgggactgcgtggctcaaagatgctagttctttcatgattatgtgataggtggggcatggccgttcttagttcgcggagtgatatgtctgcttaattgcgtatcaataatagagacctagtatacgtgcattactcatgtgggagtgaccccctcttcgcggaggcgcgtgtcgcacatatggtatgcgcactggtctcagatagcaacgaacgtgaccgtattctattgtgggagtgaattatacgtgttataccctcccggggtactcacatcccactgcttagggtgcgcggcgtatttcggtactcgcgtcacacattaaactatagagaccgctgtttcttctttaaaccagaggaaggatacggcaataacaggtctgtgatgccctcagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgatcattgcgctgtgcatctaaccaaatgtgcgcggacgccccgatttgtgatttttgctttcgggcattattacatatttgcttgtgcgactgcgccgaacctacttcgaaagtaaaattttttagtgggtaatccattagaaataatgactctcataaaccatggcacactttatgtgcgcgcaggtctacccggctccctttgtgtgagtgcagggcgaacttgttgtttctacgtgccccccccctattaattcgtacgtggggatagacaattgtttaatttgtgggcctcgtcctaaacaagaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaaaacccccctgccctttgtaaacacgccagcgctcttaccgatgggatatac

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Other sequence

LSU partial

>Ammonia falsobeccarii | genomic DNA | F277 | taxon:1004394 | large subunit ribosomal RNA cgtataatagaaactaaccaggattcccttagtaacggcgagtgaactgggataccaatatacaatatgcactacgtgcatactttagcccgtcgatactatcctagcatatcaccggtctcggccggtaaccaaatatgcgggaattgtagcatcgtaacaacaatacaaatatatgtatacgcacaacacacacacgctgggcgtgcttgatatagcttgtacacacacaccgcctctgcgatggaaagcatatatatatcttctttgtgtatgagatagagagtgacaccctcgattgactcacacatatatgagacacacacacacacacagacgcgtgcacgcnctatgtgttaactcacttgattctatatattt

See sequence on NCBI

Specimen F77

Cibicidoides lobatulus_F77
Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides lobatulus
Isolate number F77
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on October 2006
Habitat Epizoic/Tunicate
Depth 148m
Location Norway, Bergen
Latitude, Longitude 60.18, 5.12

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicides lobatulus | genomic DNA | F77 | taxon:325267 | small subunit ribosomal RNA | s14-sB tggcttaatttgactcaacgcgggaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacgttttgcttcggtaacatcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtgtgttgcatcgcactttgacccctttctttaattagagagcgcgtgtcttagttttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacatgttttgcgtcaattttcgaattgcgcgcatttcatgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgacagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggttaccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttattctgcacacctatggaaacttaaacgaa

See sequence on NCBI

Specimen F8

Species Rotaliida > Incertae sedis > Cibicidoides > Cibicidoides ungerianus
Isolate number F8
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on October 2006
Habitat Epizoic/Tunicate
Depth 148m
Location Norway, Bergen
Latitude, Longitude 60.18, 5.12

Barcode sequence

SSU partial

>Cibicidoides ungerianus | genomic DNA | F8 | taxon:673210 | small subunit ribosomal RNA | s14-sB atgtggcttattttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacttttgcttcggcacttggtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctataaatttacgtatgttgcatcgcactttgacccctttcttaattgaaagcgcgtgtcttagtttcgctttgctcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgcctttataccaaacgtgtttgtataatttttattacgcattcacgaaaaaaggctttttaaactagagggaccgctgttactttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcaccttcgggtgttttaaatgtgtacttctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttagcacacatatatacggcgtctatgcccgggctgccttgttgtagcttttgtgcgtatagatgttttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcaggaatttatttctgcacaccttatggaaaactaaaacg

See sequence on NCBI

Specimen U169

Uvigerina peregrina_169
Species Rotaliida > Uvigerinidae > Uvigerina > Uvigerina peregrina
Isolate number U169
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on May 2003
Habitat soft sediment
Depth 92m
Location Skagerrak
Latitude, Longitude 58.528, 11.0675

Barcode sequence

SSU partial

>Uvigerina peregrina | genomic DNA | U169-2 | taxon:212521 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatgtgtgacttttttgtctctcacgagtgagaaagcttacgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttgattgcactttgacccctccttcacgggtgcgtgtgtctttgctttgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtataccatttataacacagttttttttatatatgtattcgtacatcatataaaattgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacattgccttcacgggctgtgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgtgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctctgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaaggactgggaacgcatcgcgtttacgctttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

Specimen U184

Uvigerina peregrina_U184
Species Rotaliida > Uvigerinidae > Uvigerina > Uvigerina peregrina
Isolate number U184
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on May 2003
Habitat soft sediment
Depth 60m
Location Skagerrak
Latitude, Longitude 58.5815, 11.0543

Barcode sequences

SSU partial

>Uvigerina peregrina | genomic DNA | U184-5 | taxon:212521 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatgtgtgacttttttgtctctcacgagtgagaaagcttacgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgctgttgattgcactttgacccctccttcacgggtgcgtgtgtctttgctttgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtataccatttataacacagttttttttatatatgtattcgtacatcatataaaattgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatcccattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacattgccttcacgggctgtgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgtgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacaggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaaggactgggaacgcatcgcgtttacgctttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

SSU partial

>Uvigerina peregrina | genomic DNA | U184-2 | taxon:212521 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatgtgtgacttttttgtctctcacgagtgagaaagcttacgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttgattgcactttgactcctccttcacgggtgcgtgtgtctttgctttgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtataccatttataacacagttttttttatatatgtattcgtacatcatataaaattgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcgtctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacattgccttcacgggctgtgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgtgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaaggactgggaacgcatcgcgtttacgctttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

Specimen U195

Uvigerina peregrina_U195
Species Rotaliida > Uvigerinidae > Uvigerina > Uvigerina peregrina
Isolate number U195
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on May 2003
Habitat soft sediment
Depth 60m
Location Skagerrak
Latitude, Longitude 58.5815, 11.0543

Barcode sequence

SSU partial

>Uvigerina peregrina | genomic DNA | U195-2 | taxon:212521 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatgtgtgacttttttgtctttcacgagtgagaaagcttacgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttgattgcactttgacccctccttcacgggtgcgtgtgtctttgctttgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtataccatttataacacagttttttttatatatgtattcgtacatcatataaaattgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacattgccttcacgggctgtgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgtgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaaggactgggaacgcatcgcgtttacgctttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgcagaaggataa

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Specimen U239

Uvigerina phlegeri_U239
Species Rotaliida > Uvigerinidae > Uvigerina > Uvigerina phlegeri
Isolate number U239
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on October 2003
Habitat soft sediment
Depth 321m
Location Portugal, Nazaré Canyon
Latitude, Longitude 39.388, -9.15

Barcode sequences

SSU partial

>Uvigerina phlegeri | genomic DNA | U239-2 | taxon:503359 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatatactttctctctcgcactctcacgagtgtgtgtgctgtaaagtcatatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcctaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttattgcactttgacccctccttcgcgggtgcgtgtgtctttgactgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtatacccttataacacagttatatttttattttatgctttaccgcatatatactaatttgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttattatacaccgcatgcgcgagtccatttattcattttaccttcgggttatgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgcgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcattgcgtatatcttatgcgctctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

SSU partial

>Uvigerina phlegeri | genomic DNA | U239-5b | taxon:503359 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatatactttctcgcactctcgagtgtgctgtaaagtcatatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttattgcactttgacccctccttcgcgggtgcgtgtgtctttgactgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtatacccttataacacagttatatttttattttatgctttaccgcatatatactaatttgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcatttattatacaccgcatgcgcgagtccatttattcattttaccttcgggttatgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgaaagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgcgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgcattgcgcgtatatttcatatgcgctctgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaagctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

Specimen U26

Uvigerina peregrina, Norway, Oslofjord
Species Rotaliida > Uvigerinidae > Uvigerina > Uvigerina peregrina
Isolate number U26
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2001
Habitat soft sediment
Depth 195m
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.382, 10.373

Barcode sequence

SSU partial

>Uvigerina peregrina | genomic DNA | U26-1 | taxon:212521 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatgtgtgacttttttgtttctcacgagtgagaaagcttacgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttgattgcactttgacccctccttcacgggtgcgtgtgtctttgctttgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttactttcgtataccatttataacacagttttttttatatatgtattcgtacatcatataaaattgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacattgccttcacgggctgtgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttctttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgtgtatagttgtaccctttctccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaaggactgggaacgcatcgcgtttacgctttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

Specimen U27

Species Rotaliida > Uvigerinidae > Uvigerina > Uvigerina peregrina
Isolate number U27
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2002
Habitat soft sediment
Depth 195m
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.382, 10.373

Barcode sequence

SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatgtgtgacttttttgtctttcacgagtgagaaagcttacgtacattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttgattgcactttgacccctccttcacgggtgcgtgtgtctttgctttgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtataccatttataacacagttttttttatatatgtattcgtacatcatataaaattgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatggattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacattgccttcacggggctgtgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgtgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaaggactgggaacgcattgcgtttacgctttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaac

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Other sequence

SSU total

>Uvigerina peregrina | genomic DNA | U27 | taxon:212521 | small subunit ribosomal RNA ctcaagattaagccatgcaagtggttacattaacccgacagtttaaataagtgttcaatgctatcacgcatatatgcaatgcatgcaaaaatatatttacgcatacacacacacacacccgcgcatatatattaaggcaagcaacgcatgaattttgtttacgatagtaacaaaatttcagcgtgaatcacacatacgcacacagtgaatcaaagcgaaattttacaatttcaacgtatcacttacgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgacttggcacacacacacacacacacacacgatttctctgtatcgcatattcatacaagaagaaaattgcgttacaccgtgacactttttatcttttttatggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgagtacaatacacacacacacacacacacacactctatacamtactcaacactcagtgrtaatctttgatttaygtgtattcttacgcgtctatcawtataaagtttaatcgcaacatgagagacattgagcacgcacgtgtartgtgaatttattcacgttacacacccacgctgagcagactktgcgaagtttacttttgcgaagcatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcaccgtacaatgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaatgctagtaccctacaatcatactatatttgcaatttactttattacgcattacgacactgtactattttattctgttatacacacacacacacacatccttgttcacacgcgtaagtaagttattatatatatacgtatattttatttactgaggcagtgacaagctgtaacggttgagtataaaaatgacgagtgtctggcattgccgctccttcgggagcttggcaagttgccgacgctttgtgtgctcaattggaatgcggtgagtttaagcaactcagaaccttttaacggtgttacgtaaaaatttcactgttgatgtatctgaattcaagtggagggcaagtctggtgcnnnnnnccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactgcaatatgaattttttattcgctaataaattctatatttcagtattctcgcatatgtgtgatacacacacacacacacctacatacatatgcgttcgacgctgttatttcaaatatacgcgtcttgtatatttcttacggcaatttttttttctgcgacatgcacacacacacacacacacacacatttgtgcaccactcgcacacggggaaaatttttgtcactagtatttattcgcaatacacacacactcatatttcaacactgtgaacaaatcagagtgtatcaaacatgtcgtttttgaatgtgcattgaatgtcttatcatgggatgttgcactttcataccggttaaagatttacgtcttcgatcacacacacacatgttacgcatacacacatacacacgctttcgcgagcgcgcgtaatttacaaggtcgctaaatatttctttaacggttaaaaatgtcgatggagatagttggagtcaacagtactgctgggcgagaggtgaaattcattgaccctagcaagactaccaaaagcgaaagcagttgggctaggctatactctttgtgattatattatatacgtacacccacacacactcacacacacacatgtatattatttttttgcgcatacacacacacacacacttgcgcatcaacaattgttacatacacacgcgtatattttttaatacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattaattacatcaaacgatgggctctcaattgcatttattcacaataaattgcaaatttcctcagcctacaaaatttattcggcttgagctcgtgattctatcacgctcgcctatagtattttttcgtatggtctcgatggacgtttcatttatttatattttttgcgtgtaagcattatgttattctttgaaacataagaatgcattgcgtgcacttgattttcggagctttgcgctcaattctggtgagatgtaagcactatgttattctgcccgtaccgcgtatgtgttcactcacatttcgcctggtatccgtgtgcagtatttaacaatttcggtgtgaagcacgctttaggcacgcgcttactgcagaaatgtctgagacattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatgtgtgacttttttgtctttcacgagtgagaaagcttacgtacattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttgattgcactttgacccctccttcacgggtgcgtgtgtctttgctttgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtataccatttataacacagttttttttatatatgtattcgtacatcatataaaattgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatggattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacattgccttcacggggctgtgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgtgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaaggactgggaacgcattgcgtttacgctttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaac

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Specimen U273

Uvigerina elongatastriata_U273
Species Rotaliida > Uvigerinidae > Uvigerina > Uvigerina elongatastriata
Isolate number U273
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on October 2003
Habitat soft sediment
Depth 151m
Location Portugal, Nazaré Canyon
Latitude, Longitude 39.385, -9.1699

Barcode sequences

SSU partial

>Uvigerina elongatastriata | genomic DNA | U273-5 | taxon:212520 | small subunit ribosomal RNA aacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacacacacacacacacgcgcgctctcacgtgctgttgtgtgtgctgtagtgcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggttcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaatttacgtatgtcagttatttttttacactttgacccctctgcttcacgtttcattacgctgcagtgcgtgtgtctttgttcttataaattaactcatacaatttaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttctttacgtgggtattaactacactcacacacatatacacactgcgtgtaaatgtgcgcgaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttttatacaccgcatgcgcgagtccatttatttagcatcgtgtatttacgtacgcgtgtttttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctatttttttatattntgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgcgtatagttgtaccctttttccgtatgtgtgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtnttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgagggactgggaacgctgtaaatatattttttttttacgaatatattctta

See sequence on NCBI

SSU partial

>Uvigerina elongatastriata | genomic DNA | U273-4b | taxon:212520 | small subunit ribosomal RNA aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatacacacacacacacacgcgctctcacgtgctgttgtgtgtgctgtagtgcgtattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaatttacgtatgtcagttatttttttacactttgacccctctgcttacgtttcattacgctgcagtgcgtgtgtctttgttctataaattaactcatacaatttaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttctttatgtgggtattaactacactcacacacatatacacacatgcgtgtaaatgtgcgcgaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttttatacaccgcatgcgcgagtccatttatttagcatcgtgtatttacgtacgcgtgttttttttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttcctatttttttatattctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgcgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctyttaccgatggacttctntgtgagtttgagggactgggaacgctgtaaatatattttttttttacgaatatattcttatgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgcagaaggatca

See sequence on NCBI

Specimen U32

Species Rotaliida > Uvigerinidae > Uvigerina > Uvigerina peregrina
Isolate number U32
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2002
Habitat soft sediment
Depth 195
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.382, 10.373

Barcode sequence

SSU partial

>Uvigerina peregrina | genomic DNA | U32 | taxon:212521 | small subunit ribosomal RNA cgcgggaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatgtgtgacttttttgtctttcacgagtgagaaagcttacgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttgattgcactttgacccctccttcacgggtgcgtgtgtctttgctttgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtataccatttataacacagttttttttatatatgtattcgtacatcatataaaattgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacattgccttcacgggctgtgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgtgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaaggactgggaacgcatcgcgtttacgctttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgctgatggatca

See sequence on NCBI

Specimen U67

Uvigerina peregrina_U67
Species Rotaliida > Uvigerinidae > Uvigerina > Uvigerina peregrina
Isolate number U67
Collector Magali Schweizer
Identifier Magali Schweizer
Collected on April 2002
Habitat soft sediment
Depth 87m
Location Oslofjord, Norway
Latitude, Longitude 59.382, 10.373

Barcode sequence

SSU partial

>Uvigerina peregrina | genomic DNA | U67 | taxon:212521 | small subunit ribosomal RNA aaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacaggcaatattaatatgtgtgacttttttgtctttcacgagtgagaaagcttacgtatattatgttaaatatgctagtcctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcactaagggcctatacaattacgtatgttgttgattgcactttgacccctccttcacgggtgcgtgtgtctttgctttgcttcaactcatacaattaggtcctgaaagcaacgaacgtgaccgcaacctcttgttgctttcgtataccatttataacacagttttttttatatatgtattcgtacatcatataaaattgctgtgcaagaaagctttttaaactagagggaccgctgttatcttcttaaaccagaggaaggttgcggcaataacaggtctgtgatgcccttagatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattattgcagtgagcatctcattttttacacaccgcatgcgcgagtccatttattcacattgccttcacgggctgtgctttaaatgtgtatctctgcgcgcggtaaagcctgcttcgagagtaagtgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttctgcacacatatatacggcagctatacccgggtaaccttgttgttacttttgtgtgtatagttgtaccctttttccgtatgtgcgattgtcaattcatggtggggacagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtctttggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatggacttctctgtgagtttgaaggactgggaacgcatcgcgtttacgctttgcacacctatggaaacttaaacgaacagtgtggtctaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgc

See sequence on NCBI