Specimens found in “Macro algae” (3)

Specimen A108

E. margaritaceum A108 E. margaritaceum A108 E. margaritaceum A108
Species Rotaliida > Elphidiidae > Elphidium > Elphidium margaritaceum
Isolate number A108
Collector Loic Pillet
Identifier Loic Pillet
Collected on August 2007
Habitat Macro algae
Depth 0
Location English Channel, Roscoff, France
Latitude, Longitude 48.7273, -3.99092

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SSU partial

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>Elphidium margaritaceum | genomic DNA | A108.1 | taxon:933848 | SSU | SSU | small subunit ribosomal RNA ctcaaagattaagccatgcaagtggttaatatattaaccctatcagtttaaacatacgcgcaagcgtacatgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgactcggtttatattatcatacggcgctctacggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgaacaacttctattgtcgcatacagttacgcatgaatgagattgtatacgtgcgcatgaatttatattcatcgcacaaggcagatattgtaatttattacgatacatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgagccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcactgtacattgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcagacgcgtaaattgcccaataatagtacatacggtatattcactctcattctattgaggcagcgataagctgtaacggttgagtattaatctaatttgacgtgtatctggcatgcgttatacgtttacgcgtatattactgcatacgccgacactatgtgtgctcagtctggaatgcggtgagtctaaacaactcagaacctatatttgatttatgtatctgaattttcaagtggagggcaagtctggtgccagcagccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaacaaccaatatacacaatactgtgatcaaatcagcacgtatcacgtatgtaatattatacgcattgtatgtttattcatggaatgttgtatttttatacgtcgatggggatagttggagtcaacagtactagtaggcgagcggtgaaatgcattgaccctaccaagactaccaaaagcgaaagcagttgtctaggctatattctttatacagtactacacgtacacgtacacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattttatacatcaaacgatgggttctcactcgaccaaaaacaaaaatatattcgtatattcgtatacgttatatatcatattcgattttccaagctttgcgctcaatttatatacggtgagatgtaagtaatggctgcgtatttattacgtatgctatattatgatgcacgcattaggcatgcgcttactgcagaaatgtctgagatattcccctccgggggtagtatgcacgcaggtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacagacaaacaactattgttgttacaaagatgctagttctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcaatatttaaatacgtatacgtatgacccaatacattgtatcgcgtgtctagtatgctatcatttgaaagcaacgaacgtgaccgtatccttttattaatatactacacacgtatatattcattattaaagggaccgctgtttctttcttttaaaccagaggaaggttacggcaataacaggtctgtgatgcccttcgatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattatttcattaagtatctcgtatatatgtgcatatagctcttatataaatcctaccctgagaatgggcgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttatacgcaaccatgtaccgttatattacatcccacacatattatttatgcgtgcgtgtgtgttttattattgtgtacgcgtaactgttaattcatggtggggatagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtcattggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatgaacttcgctatgaatctattggactgtacgcatgtacggaaagatatatgaatagtgtggtttaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgctgatggatcatta

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>Elphidium margaritaceum | genomic DNA | A108.2 | taxon:933848 | SSU | SSU | small subunit ribosomal RNA aaccctatcagtttaaatatacgcgcaagcgtacatgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgactcggtttatattttcgatcatacggcgctcaacggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgaacacacttctattgtcgcatacagttacgcatgaatgagattgtatacgtgcgcatgaatttattcatcgcacaaggcagatattgtaatttattacgatacatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcactgtacattgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaataatagtacatacggtatattcactctcattctattgaggcagtgataagctgtaacggttgagtattaatctaatttgacgtgtatctggcatgcgttatacgtttacgcgtatattactgcatacgccgatactatgtgtgctcagtctggaatgcggtgagtctaaacaactcagaacctatattaatttatgtatctgaattttcaagtggagggcaagtctggtgccagcagccgcggtaataccagctccactggmctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaacaaccactatacacaatactgtgatcaaatcagcacgtatcacgtatgtattttttaatacgcattgtatgtttattcatggaatgttgtatttttatacgtcgatggggatagttggagtcaacagtactagtaggcgagcggtgaaatgcattgaccctaccaagactaccaaaagcgaaagcagttgtctaggctatattctttatacagtactacacgtacacgtatacacacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattttatacatcaaacgatgggttctcactcgaccaaaaacaaaaatatattcgtatattcgtatacgttatatatcatattcgattttctaagctttgcgctcaatttatatacggtgagatgtaagtaatggctgcgtatttattacgtatgctatattatgatgcacgcattaggcatgcgcttactgcagaaatgtctgagatattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacagacaaacaactattagttgtgtacaaagatgctagttctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcaatatttaaatacgtatacgtatgacccaatacattgtattgtgtgtctagtatgctatcatttgaaagcaacgaacgtgaccgtatccttttattaatatactacacacgtatatattcattattaaagggaccgctgtttctttcttttaaaccagaggaaggttacggcaataacaggtctgtgatgcccttcgatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattatttcattaagtatctcgtatatatgtgcatatagctcttatataaatcctaccctgagaatgggcgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttatacgcaaccatgtaccgttatattacatcccacacatattatttatgcgtgcgtgtgtgttttataaattgtgtacgcgtaactgttaattcatggtggggatagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtcattggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatgaacttcgctatgaatctattggactgtacgcatgtacggaaagatatatgaatagtgtggtttaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgctgatggatcatta

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Specimen A13

E. margaritaceum A13 E. margaritaceum A13 E. margaritaceum A13
Species Rotaliida > Elphidiidae > Elphidium > Elphidium margaritaceum
Isolate number A13
Collector Loic Pillet
Identifier Loic Pillet
Collected on August 2007
Habitat Macro algae
Depth 0
Location English Channel, Trebeurden, France
Latitude, Longitude 48.7878, -3.5823

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SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacagacaaacaatttatattgttacaaagatgctagttctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcaatatttaaatatgtatacgtatgacccaataactatgttgttgtgtgtctagtattactatcatttgaaagcaacgaacgtgaccgtatccttttattatatacacacatgtatatctttttaaagggaccgctgttttctttcttttaaaccagaggaaggttacggcaataacaggtctgtgatgcccttcgatgttccgggctgcacacgtgctacaatgatcatttcattaagtatcttgtgtatgtctcatacgatcctaccctgagaatgggcgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttatacgcaaccatgtaccgttatattacatcccatatacttacgtgtatgcgtgtgtgttttattattcgtttgtacgcgtaactgttaattcatggtggggatagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtcattggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatgaacttcgctatgaatctattggactgtactctgtgtacggaaagatatatgaatagtgtggtttaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgctgatggatcatta See sequence on NCBI

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SSU total

>Elphidium margaritaceum | genomic DNA | A13 | taxon:933848 | SSU | SSU | small subunit ribosomal RNA ctcaaagattaagccatgcaagtggttatyttwaaaccctatcagtttaaatatacgcgcaagcgtacatgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgactcggttactactactacgctcttacggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgaacaaattctatattcgcatacagttacgcatgaatgagattgtatacgtgcgcatgtttattcatcgcacacggcagatattgtaattttattacgatacatgtcatacaagcatctacagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcactgtacattgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaataatagtacatacggtataattacttcacctcattctattgaggcagtgataagctgtaacggttgagtattaatctaatttgacgtgtatctggcatgcgttatacgtttacgcgtatattactgcatacgccgatactatgtgtgctcagtctggaatgcggtgagtctaaacaactcagaacctatgtttcattacatgtatctgaattttcaagtggagggcaagtctggtgccagcagccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaacaaccaattgttacaatactgtgatcaaatcagcacgtatcacgtatgcatttttaatatgcattgtatgtttattcatggaatgttgtatttttatatgtcgatggggatagttggagtcaacagtactagtaggcgagcggtgaaatgcattgaccctaccaagactaccaaaagcgaaagcagttgtctaggctatattctttatacattacactctgtattcacactctttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattttatacatcaaacgatgggttctcactcgaccaaaaacaaaatatatttatacgttttacgtattttatattattttactgattttctaagctttgcgctcaatttatatacggtgagatgtaagtaatggctgcgtattttattacgtgtgctaaattatgatgcacgcattaggcatgcgcttactgcagaaatgtctgagatattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacagacaaacaatttatattgttacaaagatgctagttctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcaatatttaaatatgtatacgtatgacccaataactatgttgttgtgtgtctagtattactatcatttgaaagcaacgaacgtgaccgtatccttttattatatacacacatgtatatctttttaaagggaccgctgttttctttcttttaaaccagaggaaggttacggcaataacaggtctgtgatgcccttcgatgttccgggctgcacacgtgctacaatgatcatttcattaagtatcttgtgtatgtctcatacgatcctaccctgagaatgggcgggtaatcaattagaagtaatgatttccttttttttatacgcaaccatgtaccgttatattacatcccatatacttacgtgtatgcgtgtgtgttttattattcgtttgtacgcgtaactgttaattcatggtggggatagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtcattggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatgaacttcgctatgaatctattggactgtactctgtgtacggaaagatatatgaatagtgtggtttaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgctgatggatcatta

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Specimen A53

E. aculeatum A53 E. aculeatum A53 E. aculeatum A53 E. aculeatum A53
Species Rotaliida > Elphidiidae > Elphidium > Elphidium aculeatum
Isolate number A53
Collector Loic Pillet
Identifier Loic Pillet
Collected on August 2007
Habitat Macro algae
Depth 0
Location English Channel, Trebeurden, France
Latitude, Longitude 48.7878, -3.5823

Barcode sequences

SSU partial

aagggcaccacaagaacgcgcggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacagacaaacacatttatgtgttataaagatgctagttctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcaatattttattacgtatacgtatgaccaacttacctttaccggtatgtttgtgtctagtatgctatcatttgaaagcaacgaacgtgaccgtatccttttattatgtacgcacgcgtatatttatttcattaaagggaccgctgtttctttctttaaaccagaggaaggttacggcaataacaggtctgtgatgcccttcgatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattacttcattaagtatctaatctttatgtatcgtacctctgtgtatgttcaaaatacctaccctgagaatgggcgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttaatacgcaactatgtaccgtatattacatcccacatatttttatatatgtgcgtgtgtgttttattaccgtgtacgcgtaactgttaattcatggtggggatagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtcattggttcaacaaaccacccggaatgcgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatgaacttcgctatgaatctattggactgtgctctcttatgagtgcggaaagatatatgaatagtgtggtttaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgctgatggatcatta

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SSU total

>Elphidium aculeatum | genomic DNA | A53.1 | taxon:46086 | SSU | SSU | small subunit ribosomal RNA ctcaaagattaagccatgcawgtggttattttttaataaccctatcagtttaaatatacgcgcaagcgtacatgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgactcggtttaactaatttacgaacaacggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgaacaattattattgcatacagttacgcatgaatgagattgtatacgtgcgcgtgcttgcaccgcacacggcagatattgtgtatttataacacgatacatgtcatacaagcatctatagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcactgtacattgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaataatagtacaaaaacacagtgaacatttctagctctcatatatctattgaggcagtgataagctgtaacggttgagtattaatctaatttgacgtgtatctggcatgcgttatacgtttacgcgtatattactgcatacgccgatactatgtgtgctcagtctggaatgcggtgagtctaaacaactcagaacctacgtttttatacgtgtatctgaattttcaagtggagggcaagtctggtgccagcagccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactaaatatttttattatatttacaacactgtgatcaaatcagcatgtatcacgtatgtattactaatacacgcattgtatgtttattcatggaatgttgctctgtattttattatacaattatacgtcgatggggatagttggagtcaacagtactagtaggcgagcggtgaaatgcattgaccctaccaagactaccaaaagcgaaagcagttgtctaggctatattctttgtacttgtactatatacattattatacaatacacacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattttatacatcaaacgatgggttctcactcgaccaaaaatacatatcaagacttgcagtacatacttctgtactcgtctatattactgattttctaagctttgcgctcaattttatacggtgagatgtaagtaatggctgtatctttatgatgcatgctatattatgatgcacgtattaggcatgcgcttactgcagaaatgtctgagatattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgcggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacagacaaacacatttatgtgttataaagatgctagttctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcaatattttattacgtatacgtatgaccaacttacctttaccggtatgtttgtgtctagtatgctatcatttgaaagcaacgaacgtgaccgtatccttttattatgtacgcacgcgtatatttatttcattaaagggaccgctgtttctttctttaaaccagaggaaggttacggcaataacaggtctgtgatgcccttcgatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattacttcattaagtatctaatctttatgtatcgtacctctgtgtatgttcaaaatacctaccctgagaatgggcgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttaatacgcaactatgtaccgtatattacatcccacatatttttatatatgtgcgtgtgtgttttattaccgtgtacgcgtaactgttaattcatggtggggatagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtcattggttcaacaaaccacccggaatgcgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatgaacttcgctatgaatctattggactgtgctctcttatgagtgcggaaagatatatgaatagtgtggtttaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgctgatggatcatta

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>Elphidium aculeatum | genomic DNA | A53.2 | taxon:46086 | SSU | SSU | small subunit ribosomal RNA tattttttaataaccctatcagtttaaatatacgcgcaagcgtacatgcaactgcagacagctgcttaatacagtcacacttgtcttgactcggtttaactaatttacgaacaacggataactcagggaaagtttggctaatacgtacgaacaattattattgcatacagttacgcatgaatgagattgtatacgtgcgcgtgcttgcgccgcacacggcagatattgtgtatttataacacgatacatgtcatacaagcatctatagcatcaagtcacagggttggcaagtgtatttttgaaccttcaaagcagtcacgcatacggaagagtagtttctgatcccatagaaggagcactgtacattgagagaccgctcttagttctaaggaacgcagcaggcgcgtaaattgcccaataatagtacaaaaacacagtgaacatttctagctctcatatatctattgaggcagtgataagctgtaacggttgagtattaatctaatttggcgtgtatctggcatgcgttatacgtttacgcgtatattactgcatacgccgatactatgtgtgctcagtctggaatgcggtgagtctaaacaactcagaacctacgtttttatacgtgtatctgaattttcaagtggagggcaagtctggtgccagcagccgcggtaataccagctccactggcctatacaatcattgttgcggttaagaggctcgtagttggattgaactaaatattttatatatttacaacactgtgatcaaatcagcatgtatcacgtatgtattactaatacacgcattgtatgtttattcatggaatgttgctctgtattttattatacaattatacgtcgatggggatagttggagtcaacagtactagtaggcgagcggtgaaatgcattgaccctaccaagactaccaaaagcgaaagcagttgtctaggctatattctttgtacttgtactatatacattattatacaatacacacactttacaatgaagaacgaaggttgggggatcaaagaggatcagataccctcgtcgtcccattttatacatcaaacgatgggttctcactcgaccaaaaatacatatcaagacttgtagtacatacttctgtactcgtctatattactgattttctaagctttgcgctcaattttatacggtgagatgtaagtaatggctgtatctttatgatgcatgctatattatgatgcacgtattaggcatgcgcttactgcagaaatgtctgagatattcccctccgggggtagtatgcacgcaagtgtgaaacttgaaggaattgacggaagggcaccacaagaacgcgtggagcatgtggcttaatttgactcaacgcgggaaatcttaccgggtccggacacactgaggattgacagacaaacacatttatgtgttataaagatgctagttctttcatgattatgtgataggtggtgcatggccgttcttagttcgtggagtgatctgtctgcttaattgcgtttcaatattttattacgtatacgtatgaccaacttacctttaccggtatgtttgtgtctagtatgctatcatttgaaagcaacgaacgtgaccgtatccttttattatgtacgcacgcgtatatttatttcattaaagggaccgctgtttctttctttaaaccagaggaaggttacggcaataacaggtctgtgatgcccttcgatgttccgggctgcacacgtgctacaatgattatttcattaagtatctaatctttatgtatcgtacctctgtgtatgttcaaaatacctaccctgagaatgggcgggtaatcaattagaagtaatgatttcctttttttaatacgcaactatgtaccgtatattacatcccacatatttttatatatgtgcgtgtgtgttttattaccgtgtacgcgtaactgttaattcatggtggggatagaccattgttaattgttggtctcggtcttaactaggaatgccttgtacgggtcattggttcaacaaaccacccggaatacgtccctgccctttgtacacaccgcccgtcgctcttaccgatgaacttcgctatgaatctattggactgtgctctcttatgagtgcggaaagatatatgaatagtgtggtttaaaggaaagagaagtcgtaacaaggcatcagtaggtgaacctgctgatggatcatta

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